Здравствуйте, я получила предложение о работе в Бельгии, Гент. Мой работодател…

Нет никаких ограничений по дипломам со стороны бельгийской бюрократии. Запрос на получение разрешения на работу (и вида на жительство) для Вас должен делать работодатель. Выдадут разрешение или нет, зависит не от Вашего диплома, а от его желания и способности доказать, что Вы незаменимый сотрудник, который сюда должен приехать на работу. Ну, и еще всякие неспецифические мелочи вроде доказательства работоспособности (нет медицинских проблем), соблюдение визового режима, и т.д. Одним словом, если работодатель захочет (и сможет), то сделает, не захочет (не сможет) - нет. Тут от Вас мало что зависит. Тот факт, что он просит диплом, якобы для оформления разрешения на работу, может говорить о том, что он сам еще не решил, брать Вас, или нет.

компенсации учитываются - например от компании оплата первых полгода за аренду жилья(через полгода зарплата будет пересмотрена и повышена чтобы я могла платить за жилье сама и при этом мочь покушать), оплата транспорта за все время работы в компании, полная оплата мед страховки и т.д.

Для получения разрешения на работу, если ничего не поменялось я января, то компетентным органом (в вашем случае - так как работодатель фламандский - это Dienst economische migratie VDABa ) учитывается только брутто зарплата, и именно та, что представлена в контракте, и если она меньше той референтной цифры, что я выше приводил, то могут завернуть;
Компенсации для этой процедуры не учитываются, они будут учитываться при налогообложении, что ваш работодателя возможно и запутало (мол раз налоговая считает компенсации доходом путём взимания с них налога, то и для других процедур это так же. Но это не так, налоговая тут и с мертвых снимает налог, но они не оживают после этого (хотя за такие цифры можно и из гроба восстать);

Уровень зарплаты, это первый рубеж.
Если вы и работодатель подсуетитесь и доведёте цифру в контракте до требуемой суммы, то следующее препятствие, которое нужно будет преодолеть, это диплом. Вы сказали, что у вас на базе 9 классов (это обычно среднее профессиональное). Тут важно именно то, что базой для вступление в это УЗ была неполная школа, то есть как бы как минимум 2 года из 4х были "поглощены" школой и на собственно высшее после-школьное осталось 2 года, что явно недостаёт до здешнего минимума высшего образования (3 года или 180 кредитов).
Если чиновник фламандского Минтруда не будет заморачиваться, то может и проскочит. Но именно фламандские госучреждения славятся здесь своим буквальным подходом к интерпретации бумажек, к тому же у них есть база прецедентов и образцов, с которыми они могут сверяться - то есть в принципе выяснить, что это диплом не подходит под определение "высшего" образования им будет нетрудно.

Я к чему это говорю, отчаиваться не нужно, надежда есть всегда, но вам трезво смотреть на вещи нужно, чтобы вовремя увидеть и исправить;
в вашем досье есть два главных звена и оба они слабые - номинальная з/п и диплом.
Вы не можете себе позволить чтобы ОБА этих элемента были слабыми;
выправить вы пока можете только зарплату (так как диплом уже не поменяешь) , постарайтесь почитать сами (начните тут https://www.belgium.be/fr/emploi/venir_travailler_en_belgique/permis_de_travail)

что касается диплома - постарайтесь тоже не отпустить это на волю случая, доверив всё это работодателю - скорее всего кадровик попросил вас прислать скан на русском, мол мы тут сами переведём-заверим. найдите кого-то кто хорошо владеет нидерландским и посоветуйтесь, как перевести диплом так, чтобы все термины, названия квалификации и т.п. так, что на нидерландское ухо/глаз это выглядело именно как высшее образование, при этом сохранив юридический смысл (это вопрос выбора слов из множества синонимов).

Удачи.